Проблема вивчення Т-клітинного імунітету полягає в наявності неспецифічних реакцій Т-клітин, що з’явилися у відповідь на сезонні коронавіруси (HCoV). Багато наборів для визначення Т-клітинного імунітету містять пептиди з ділянками, що перекриваються у різних коронавірусів. Вчені зі Швеції оцінили чутливість і специфічність тесту на T-клітинний імунітет і можливість його використання в діагностичних цілях.
Зразки крові брали у шведських медпрацівників в рамках дослідження COMMUNITY (COVID-19 Biomarker and Immunity), присвяченого вивченню формування тривалого імунітету після COVID-19 і вакцинації. Перші зразки крові були взяті в квітні-червні 2020 року і далі кожні чотири місяці. У роботі використовували зразки 187 серопозитивних людей, які перехворіли на COVID-19 в помірній або легкій формі, у яких сформувалися антитіла як до S, так і до N-білку, і зразки 102 серонегативного людей. Також брали зразки у 55 пацієнтів, які перехворіли на COVID-19 у важкій формі. Зразки для нової роботи збирали в жовтні 2020 року.
Для оцінки формування Т-клітинної відповіді використовували FluoroSpot – метод, який дозволяє детектувати в одиничних клітинах вироблення декількох аналітів за допомогою антитіл. Для стимуляції Т-клітин використовували два комерційні набори пептидів: P166, що містить пептиди з домену S1 S-білка, і P47, що містять пептиди з S-, N- і M-білків і білків, закодованих ORF-3a і ORF-7a. Також використовували спеціально розроблений SARS-CoV-2-специфічний набір пептидів P16, в якому ділянки пептидів перекривалися з гомологічними ділянками сезонних коронавірусів не більше, ніж протягом п’яти амінокислот.
Для набору P47 специфічність тесту склала 80,4%, для P166 – 85,3%, для P16 – 96,1%. Якщо комерційні набори застосовувати разом, специфічність була 91,3%. Таким чином, комерційні набори пептидів показали досить низьку специфічність.
Тяжкість перенесеної хвороби впливала на чутливість тесту. Набір P47 показав чутливість 92,0% і 96,4%, P166 – 66,8% і 84,0%, P16 – 76,5% і 92,7%, обидва комерційні набори разом – 66,3% і 84, 5% для групи з легким і помірним перебігом хвороби і для пацієнтів з тяжким перебігом COVID-19, відповідно.
Точність тесту при використанні набору P47 склала 87,9%, P166 – 73,4%, P16 -83,4%, два комерційних набори – 75,1%. Набір P166 давав багато хибнопозитивних результатів і низьку чутливість. При використанні P47 чутливість була вище, але специфічність – нижче. Специфічність можна підвищити, але за рахунок чутливості. За своїми параметрами тест на T-клітини не може наблизитися до серологічного. Автори вважають, що існуючий тест на клітинний імунітет не підходить для застосування в клініці, але залишається важливим інструментом досліджень.